从未见过!纽约下水道发现4种新型新冠毒株,或与病毒在动物体内继续进化有关
今年4月,纽约市的一组研究人员在人类污水中寻找冠状病毒及其变异株的迹象,他们有了一个惊人的发现。
据美国纽约市非营利新闻机构The City当地时间7月29日消息,经过几个月的测试和再测试,这组研究人员发现了4种新冠病毒突变组合——与包含250多万个序列变异的全球数据库相比,这是以前从未见过的。研究人员发现,这4种变体至少在某种程度上具有抗体抗性,这可能会降低疫苗的有效性。
来自纽约市立大学皇后学院、密苏里大学等机构的病毒学家和微生物学家团队,自2020年6月以来一直在研究该市14个污水处理厂的污水,他们每周在塑料瓶中收集一次样本,并分析它们,以了解病毒的浓度。自今年1月以来,研究人员进一步分析了污水中不同的COVID-19变体。
这些数据是“初步的”(preliminary),没有经过同行评审,也没有在科学杂志上发表。一些外部专家表示,现在发出警报还为时过早。但根据研究人员周四发表的一项预印本研究,有一种令人担忧的可能性是——新的下水道突变究竟来自哪里。
预印本内容显示,初步推测新型变异毒株可能与狗、老鼠等动物被感染,新冠病毒在动物体内继续进化有关,但也不排除来自人类的可能性。
与其他动物一样,COVID-19可能会感染狗和老鼠,导致新的变异,并在纽约市的下水道暴发疫情。虽然这种病毒通过动物传染给人类的情况极其罕见,但在美国的水貂身上就发现了这种病毒。
尽管存在潜在影响,但研究人员表示,上个月向市政府官员介绍他们的发现时,反响平平。他们被告知可以进行进一步调查,但该市环境保护部(Department of Environmental Protection)最初没有为他们的努力提供额外的资金或支持。“他们不愿意帮助探索这种潜在的公共健康风险。”
纽约市卫生和心理卫生部(Department of Health and Mental Hygiene)的官员在一份声明中表示,他们已经审查了该团队的发现,他们称这些发现是“初步的”,正在努力确定病毒突变的来源。
该市指出,目前还没有确诊的老鼠感染病例。他们指出,去年冬天在比利时安特卫普(Antwerp)进行的一项研究发现,没有老鼠感染这种病毒,不过该研究也保留了一种可能性,即突变会让啮齿动物容易感染这种病毒。
卫生部发言人帕特里克·加拉赫(Patrick Gallahue)写道:“对已确定的突变有多种可能的解释,我们将与科学和政府合作伙伴讨论相关理论。”“我们从临床检测和监测中知道的一件事是,新冠正在纽约传播,纽约人保护自己和他人的最好方式是接种疫苗。”
当记录COVID-19项目和the CITY联系他们的研究时,研究人员表示,他们被禁止公开讲话。
但专家表示,初步的废水调查结果,加上市政机构最初不愿调查,反映出纽约在该市和全国范围内不断变异的病毒和病例率不断攀升之际,缩减了用于抗击病毒的资源。
“关于这种病毒,我们知之甚少,”哥伦比亚大学(Columbia University)环境工程教授卡蒂克·钱德兰(kartik Chandran)博士说。“我们需要提出这些问题,并寻找答案。”
所有的病毒都会变异,有些变异对人类健康的影响比其他变异更大。
通过对新冠病毒RNA进行测序,并关注尖峰蛋白突变,研究人员可以及早识别新的疫苗规避变异,并在阳性检测和住院率上升前几周作为疫情预警系统。在此过程中,他们还发现了城市下水道系统中4种新冠病毒的“谱系”,即冠状病毒的变种,它们是由刺突蛋白突变Q493K、Q498Y、H519N和T572N组成的。
该团队开始检测老鼠粪便中的新冠病毒,以确定这是否是新的刺突蛋白突变的来源,但没有发现与他们最初的发现相符的东西。
然后,他们使用一种动物DNA的“深度测序”方法对污水进行了调查。他们发现了各种哺乳动物的证据,如牛、猪和羊,这些动物可能来自人类的食物消费,还有狗、猫和老鼠的证据。
但大多数突变是在三个不同的污水处理厂发现的,时间跨度为几个月。这意味着“动物蓄水池”必须活跃在下水道内或附近;很大程度上受地理位置的限制;数量足够让一场流行病持续六个月。
译/前瞻经济学人APP资讯组
参考来源:https://www.thecity.nyc/2021/7/29/22600656/covid-mutations-in-new-york-city-sewage-possible-dog-rat
https://www.thecity.nyc/2020/12/3/22151704/new-york-searching-sewers-covid返回搜狐,查看更多